这个问题涉及到阴阳师游戏中的一些机制和设定。在阴阳师中，御灵是一种召唤生物，它们由阴阳师使用特殊的符咒召唤出来。每个御灵都有自己独特的属性和技能，并且可以由玩家进行培养。但是，御灵的数量是有限的，只有达到一定等级的玩家才能招募新的御灵。
为什么御灵只有三层呢？这是因为御灵的召唤机制与卡牌游戏类似。在阴阳师中，每个御灵都有自己的生命值和攻击力，并且可以通过升级和装备来提升属性。但是，御灵的生命值是有限的，只有达到一定数量时才能被召唤出来。因此，为了保证游戏的公平性和平衡性，阴阳师中的御灵只有三层。
此外，阴阳师中的御灵还有一种特殊的属性，即“灵力”。灵力是御灵的属性之一，它可以增加御灵的攻击力和生命值，并且可以用于提升其他御灵的属性。但是，御灵的灵力也是有限的，只有达到一定数量时才能增加。因此，为了保证游戏的公平性和平衡性，阴阳师中的御灵只有三层。
阴阳师中的御灵只有三层是为了保证游戏的公平性和平衡性，避免因为招募御灵过多而导致的不公平现象。通过限制御灵的等级和数量，玩家可以更好地培养自己的御灵，并在游戏中取得更好的成绩。